O CNPEM atua de forma estratégica para fortalecer o Sistema Nacional de Ciência, Tecnologia e Inovação (SNCTI), ampliando o impacto social e econômico do conhecimento produzido em suas instalações. Uma das principais formas de contribuição é a colaboração contínua com empresas de diferentes portes e segmentos, permitindo acelerar o desenvolvimento de soluções tecnológicas inovadoras capazes de resolver desafios reais do setor produtivo e chegar ao mercado com benefícios diretos para a sociedade.
Essas interações podem assumir diversas modalidades: projetos de pesquisa, desenvolvimento e inovação (PD&I), transferência de tecnologia, prestação de serviços especializados e apoio ao empreendedorismo tecnológico. As iniciativas podem ser financiadas com recursos das próprias empresas, por meio de instituições de fomento e fundos de apoio, e/ou com contrapartida econômica do CNPEM, conforme o enquadramento de cada projeto.