Na busca por avanços científicos e tecnológicos de elevado impacto intelectual, social e econômico, o CNPEM preza pela manutenção, ampliação e fortalecimento de alianças e articulações externas. O Centro atua em parcerias com instituições no Brasil e no exterior — incluindo universidades, agências de fomento, centros de pesquisa, empresas e organizações governamentais. Esses acordos de cooperação impulsionam o avanço do conhecimento e promovem a inovação, apoiam a busca de soluções para desafios em áreas estratégicas, favorecem o financiamento de projetos, ampliam as perspectivas para o estabelecimento de novas conexões e, assim, fortalecem todo o cenário de pesquisa e desenvolvimento.